تمنح الكلية درجتا الماجستير والدكتوراه بالبحث في البرامج الآتية:

علم الأدوية والسموم.

علم الصيدلانيات.

علم الكيمياء الصيدلانية:

(كيمياء طبية - كيمياء تحليلية).

علم العقاقير الطبية:

(الأدوية النباتية - كيمياء النبات).

الممارسات الصيدلانية:

(الصيدلية السريرية - الإقصاد الدوائي - الصيدلة الوبائية - الإدارة الصيدلانية - التسويق الصيدلاني).

الأحياء الدقيقية الصيدلاني:

( الأحياء الدقيقة الصيدلانية - التقانة الحيوية الصيدلانية).